อ้างอิงกระทู้ (Quote Tpoic ID) 2153 โพสแล้ว (By) ญารินดา :
บทบาทของแบคทีเรียในการเจริญเติบโตของมะเร็ง
จุลินทรีย์ที่เกี่ยวข้องกับเนื้องอกเป็นองค์ประกอบสำคัญของสภาพแวดล้อมจุลภาคของเนื้องอก (TME) ในมะเร็งของมนุษย์ 33 ชนิด อย่างไรก็ตาม มีหลักฐานเพียงเล็กน้อยเกี่ยวกับการกระจายเชิงพื้นที่และตำแหน่งที่ตั้งของจุลินทรีย์เหล่านี้ในเซลล์เนื้องอก
การจัดการกับช่องว่างนี้ในการวิจัย การ สล็อต ศึกษาในวารสาร Nature เมื่อเร็ว ๆ นี้ ประเมินปฏิสัมพันธ์เชิงพื้นที่ เซลล์ และโมเลกุลของโฮสต์และจุลินทรีย์ในมะเร็งเซลล์สความัสในช่องปาก (OSCC) และมะเร็งลำไส้ใหญ่ (CRC) ในการศึกษานี้ นักวิทยาศาสตร์ทำแผนที่ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโฮสต์กับแบคทีเรีย เซลล์ เชิงพื้นที่ และโมเลกุลภายใน TME โดยใช้การหาลำดับอาร์เอ็นเอเซลล์เดียว (scRNA-seq) และเทคโนโลยีการทำโปรไฟล์เชิงพื้นที่ในแหล่งกำเนิด
การศึกษา: ผลของจุลินทรีย์ในเนื้องอกต่อความแตกต่างเชิงพื้นที่และเซลล์ในมะเร็ง เครดิตรูปภาพ: jovan vitanovski / Shutterstockการศึกษา: ผลของจุลินทรีย์ในเนื้องอกต่อความแตกต่างเชิงพื้นที่และเซลล์ในมะเร็ง เครดิตรูปภาพ: jovan vitanovski / Shutterstock
พื้นหลัง
โดยปกติแล้ว เนื้องอกของผู้ป่วยมะเร็งประกอบด้วยเซลล์เนื้อร้ายที่ล้อมรอบด้วยเครือข่ายผสมของเซลล์ที่ไม่ใช่เนื้อร้าย เซลล์เหล่านี้อาจแสดงฤทธิ์ต้านหรือต่อต้านเนื้องอกตามปริมาณและชนิดของมัน ทั้ง การทดลองในหลอดทดลอง และ ในร่างกาย ได้บ่งชี้ถึงการมีอยู่ของแบคทีเรียในไมโครไบโอต้าที่เกี่ยวข้องกับเนื้องอก ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของมะเร็ง การตรวจภูมิคุ้มกัน การแพร่กระจาย และการรักษาทางเคมี การวิเคราะห์ระดับโมเลกุลและข้อมูลการสร้างภาพทางชีวภาพยังแสดงให้เห็นถึงการมีอยู่ของจุลินทรีย์ในเนื้องอกในมะเร็งชนิดที่สำคัญ
ไม่มีหลักฐานเกี่ยวกับเอกลักษณ์เฉพาะของเซลล์โฮสต์ซึ่งจุลินทรีย์ที่เกี่ยวข้องกับเนื้องอกทำปฏิกิริยากับเซลล์มะเร็งของผู้ป่วยมะเร็ง นอกจากนี้ยังมีเอกสารหลักฐานเพียงเล็กน้อยที่เกี่ยวข้องกับการระบุเซลล์เฉพาะที่อาศัยของสิ่งมีชีวิต ผลกระทบของปฏิสัมพันธ์ระหว่างเซลล์ของโฮสต์และจุลินทรีย์ที่แม่นยำและการกระจายเชิงพื้นที่ของ microbiota ในเนื้องอกต่อความสามารถในการทำงานภายใน TME นั้นไม่ชัดเจน
เกี่ยวกับการศึกษา
การจัดลำดับยีน 16S rRNA ของเนื้อเยื่อเนื้องอกของผู้ป่วย CRC บ่งชี้ว่ามีแบคทีเรียหลายชนิด รวมทั้ง Fusobacterium ความอุดมสมบูรณ์ของแบคทีเรียนี้แตกต่างกันระหว่างผู้ป่วยซีอาร์ซี การวิเคราะห์ Dendrogram และการวิเคราะห์องค์ประกอบหลักด้วยการจัดกลุ่มความหลากหลายเบต้าบ่งชี้ว่าผู้ป่วยมะเร็งส่วนใหญ่มีองค์ประกอบของไมโครไบโอมค่อนข้างคงที่ อย่างไรก็ตาม ผู้ป่วยส่วนใหญ่แสดงระดับความแตกต่างของความแตกต่างในองค์ประกอบของไมโครไบโอมในเนื้องอก
การถ่ายภาพ RNAscope–fluorescence in situ hybridization (RNAscope-FISH) ยืนยันการกระจายเชิงพื้นที่ที่แตกต่างกันของชุมชนแบคทีเรียใน TME ข้อมูลที่ใช้ RNAscope-FISH แสดงให้เห็นการมีอยู่ของ Fusobacterium nucleatumซึ่งได้รับการตรวจสอบความถูกต้องเพิ่มเติมผ่านการวิเคราะห์ไมโครไบโอมและเทคนิค PCR เชิงปริมาณ
10x Visium spatial transcriptomics ยังใช้ในการตรวจจับและวิเคราะห์การกระจายเชิงพื้นที่ของ intratumoral microbiota ของตัวอย่าง CRC และ OSCC วิธีการนี้ระบุจุดจับได้ 28% ภายในเนื้องอก OSCC และ 46% ของเนื้องอกซีอาร์ซี
เรื่องที่เกี่ยวข้อง
การดำเนินการทางคลินิกของการเฝ้าระวังจีโนมอย่างต่อเนื่องเพื่อระบุ ติดตาม และขัดขวางการแพร่เชื้อของแบคทีเรียก่อโรคที่ดื้อยาหลายชนิด
ยาเสริมช่วยกำจัดเซลล์มะเร็งโดยเฉพาะ แต่ไม่เป็นอันตรายต่อเซลล์ปกติ
ตัวบ่งชี้ทางชีวภาพอย่างง่ายสองตัวสามารถแยกความแตกต่างของหญิงสาวที่เป็นมะเร็งเต้านม ER+ ที่ต้องการเคมีบำบัด
ในเนื้องอก OSCC พบว่า Parvimonas , Peptoniphilusและ Fusobacterium เป็นสายพันธุ์หลัก ในขณะที่ Fusobacterium และ Bacteroides เป็นจำพวกที่โดดเด่นในเนื้องอก CRC
10x เทคนิค Visium spatial transcriptomics เปิดใช้งานการตรวจจับโดยตรง การหาปริมาณ และการทำแผนที่เชิงพื้นที่ของแบคทีเรียที่มีชีวิตภายในเนื้อเยื่อเนื้องอกที่ไม่บุบสลายของผู้ป่วยมะเร็ง นอกจากนี้ยังบ่งชี้ถึงความซับซ้อนของปฏิสัมพันธ์ของไมโครไบโอต้าในเนื้องอกในเนื้อเยื่อเนื้องอก
แพลตฟอร์ม GeoMx digital spatial profiling (DSP) ช่วยหาปริมาณโปรไฟล์การแสดงออกของโปรตีน 77 ชนิดที่เชื่อมโยงกับการลุกลามของมะเร็งและภูมิคุ้มกันต่อต้านเนื้องอก เทคนิคนี้เมื่อรวมกับ RNAscope และวิธีอิมมูโนฮิสโตเคมี (IHC) บ่งชี้ว่าชุมชนแบคทีเรียอาศัยไมโครนิชที่กดภูมิคุ้มกันสูงและไม่ได้ขยายหลอดเลือดมากนัก นอกจากนี้ สายพันธุ์แบคทีเรียมีแนวโน้มที่จะอาศัยอยู่ในเซลล์มะเร็งที่มีระดับ Ki-67 ลดลง
เทคนิค INVADEseq (การจัดลำดับนิพจน์ที่กำกับการบุกรุกและการยึดเกาะ) ได้รับการพัฒนาขึ้นเพื่อประเมินปฏิสัมพันธ์ระหว่างเซลล์กับเซลล์ระหว่างแบคทีเรียและโฮสต์ภายใน TME และผลกระทบต่อทรานสคริปโตมิกส์ของเซลล์โฮสต์ เทคนิคนี้เกี่ยวข้องกับการแนะนำไพรเมอร์เพื่อกำหนดเป้าหมายบริเวณอนุรักษ์ของแบคทีเรีย 16S rRNA ต่อจากนั้น ไลบรารี cDNA ที่มีการถอดเสียงของแบคทีเรียจากเซลล์มนุษย์ที่เกี่ยวข้องกับแบคทีเรียจะสามารถผลิตได้ ลักษณะสำคัญประการหนึ่งของวิธีนี้คือการแนะนำไพรเมอร์ไม่ส่งผลกระทบต่อโปรไฟล์การแสดงออกของยีนของเซลล์ CRC ของมนุษย์
เทคนิค INVADEseq ได้รับการตรวจสอบโดยใช้สายเซลล์ CRC ของมนุษย์ HCT116 ที่ติดเชื้อแบคทีเรีย ได้แก่ F. nucleatum , Porphyromonas gingivalisและ Prevotella intermedia เปิดใช้งานการทำแผนที่ประชากรแบคทีเรียในเซลล์เดียวของมนุษย์ ที่สำคัญ INVADEseq ยืนยันบทบาทของ F. nucleatum และ P. gingivalis ในการส่งผลต่อความแตกต่างของเซลล์มะเร็ง สายพันธุ์แบคทีเรียเหล่านี้เปลี่ยนแปลงโปรแกรมการถอดเสียงที่แตกต่างกันซึ่งช่วยในการจัดกลุ่มเซลล์เฉพาะ การเปลี่ยนแปลงของเส้นทางการถอดรหัสยังเกี่ยวข้องกับการแสดงอาการของการอักเสบ การพักตัวของเซลล์ การแพร่กระจาย และการซ่อมแซมดีเอ็นเอ
ข้อสรุป
การศึกษาปัจจุบันพบว่าเซลล์มะเร็งที่ติดเชื้อแบคทีเรียส่งผลกระทบต่อสภาพแวดล้อมเป็นเซลล์เดียว ซึ่งต่อมาจะใช้เซลล์ไมอีลอยด์ไปยังอาณาเขตของแบคทีเรีย โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ไมโครไบโอมภายในเนื้องอกพบว่าไม่ใช่ปรากฏการณ์สุ่ม แต่มีการระบุว่าการปรากฏตัวของแบคทีเรียภายในเนื้องอกเป็นกระบวนการที่มีการจัดระเบียบสูงใน microniches ที่มีการทำงานของเซลล์ภูมิคุ้มกันและเซลล์เยื่อบุผิวที่มีอิทธิพลต่อการลุกลามของมะเร็ง
แม้ว่าการศึกษาในปัจจุบันจะมุ่งเน้นไปที่มะเร็งสองชนิด แต่เครื่องมือและเทคนิคสามารถใช้เพื่อศึกษามะเร็งที่สำคัญทุกประเภทและมะเร็งที่มีจุลินทรีย์ในเนื้องอก